医疗机构违法所得的认定：医疗机构的违法所得是指未取得《医疗机构执业许可证》擅自执业的人员或机构在违法活动中获取的包括成本在内的全部收入。对于医疗机构违法所得，应当予以追缴或者责令退赔。
违法所得是收缴。犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
找法网提醒您，《中华人民共和国刑法》第六十四条
【犯罪所得、违禁品、犯罪所用物品的处理】犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
1.手段违法性
违法所得是行为人通过法律禁止的手段获取的，如果行为人通过合法的手段或途径获取的财产则不在违法所得的讨论范围之列。违法所得的这个根本特性将违法所得与行为人的个人财产区分开来，个人财产是行为人合法所有的财产，可以作为罚款、没收财产等刑罚措施的对象。
2.具有经济价值
行为人通过各种违法犯罪手段获取违法所得的根本原因在于行为人追求这些财物的经济价值。违法所得首先是指行为人通过非法手段获取的具有经济价值的物质实体，即赃款和赃物，这是违法所得最常见的形式。
3.具有证据价值
违法所得的证据价值，即指违法所得与案件之间的紧密联系性，违法所得对违法行为的发生以及违法行为的严重程度起到证明的作用，与违法行为没有关系的财物不是真正意义上的违法所得。
