员工因拒绝加班被公司辞退是不合法的，可以协商要求支付双倍辞职补偿，也可以提出劳动仲裁处理，无法协商达成一致意见的，可以起诉到法院来进行处理，具体情况可以根据实际的辞退情况来进行认定。
《中华人民共和国劳动法》第四十一条规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时； 因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
找法网提醒您，根据劳动和社会保障部门解释，以下四种情形，职工不得拒绝延长工作时间：
1.发生自然灾害、事故或者其他原因，使人民的安全健康和国家财产遭到严重威胁，需要紧急处理的。比如“非典时期”需要生产大量口罩，纺织工厂的职工就应当听从指挥，有必要牺牲个人时间加班加点生产口罩，一切以人民利益为重。
2.必须利用法定节日或公休假日的停产期间进行设备检修、保养的。
3.生产设备、交通运输路线、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的。
4.为完成国防紧急任务，或者完成上级在国家计划内安排的其他紧急生产任务，以及商业、供销企业在旺季完成收购、运输、加工农副产品紧急任务的。
员工拒绝加班纠纷的仲裁时效是1年时间。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条
劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
