医院应对医疗纠纷的合法措施是：发生医疗纠纷，医院首先可以找到患方进行沟通，看能否自行协商处理民事赔偿款项，协商成功的制作相关合同，协商不成的可向主管卫生行政部门提出处理请求。卫生行政部门受理后会指派专人妥善保管原始资料，封存有关医疗物品，组织工作人员展开调查，并形成文字材料。
找法网提醒您，医疗纠纷的鉴定程序是：
1.双方当事人在规定的时间内分别陈述意见和理由。陈述顺序先患方，后医疗机构；
2.专家鉴定组成员根据需要可以提问，当事人应当如实回答。必要时，可以对患者进行现场医学检查；
3.双方当事人退场；
4.专家鉴定组对双方当事人提供的书面材料、陈述及答辩等进行讨论；
5.经合议，根据半数以上专家鉴定组成员的一致意见形成鉴定结论。专家鉴定组成员在鉴定结论上签名。专家鉴定组成员对鉴定结论的不同意见，应当予以注明。
医疗纠纷的诉讼时效是三年。当事人因医疗纠纷提起诉讼的，应当递交起诉状。起诉超过诉讼时效的，义务人可以提出不履行义务的抗辩，但是人民法院不得主动适用。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
