辞职后签署三方协议是违约是需要支付违约金的，按照合同约定承担违约责任。
签了三方协议书违约金的计算是不超过造成的实际损失的百分之三十。如果与实际损失相比过高或过低的，则当事人可以向仲裁机构或者人民法院申请提高或者减少。
1.签订时间不同。三方协议是学生在校期间签订的，而劳动合同是在毕业生毕业离校后到单位正式报到后签订的。
2.主体不同。三方协议的主体是三方，即学校、毕业生和用人单位;而劳动合同的主体是两方，即劳动者和用人单位。
3.内容不同。三方协议的主要内容是毕业生如实介绍自身情况，并表示愿意到用人单位就业、用人单位表示愿意接收毕业生，学校同意推荐毕业生并列入就业方案;而劳动合同是记载劳动者和用人单位的权利和义务，是劳动关系确立的法律凭证。
4.目的不同。三方协议是毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定，是编制毕业生就业方案和将来双方订立劳动合同的依据。而劳动合同主要是劳动关系确立后使劳动者和用人单位的合法权益得到应有的保障。
5.适用的法律不同。三方协议的制定、发生争议后的解决主要依据是《国家关于高校毕业生就业的规定》、《民法典》等，而劳动合同的订立以及发生争议后主要是依据《劳动法》和《劳动合同法》来解决。
1.毕业生从院系就业办领取三方协议；
2.由用人单位填写甲方部分，并盖章。找法网提醒您，学生需关注就业协议的条款以及补充条款，特别是薪酬待遇和违约金等；
3.由学生填写乙方部分，并签名；
4.取得协议乙方联后，登录网站，提交去向，上传协议照片。
