事业单位合同工辞职需要以下材料：
1.《用人单位与劳动者解除劳动关系备案表一》(一式五联)、《用人单位与劳动者解除劳动关系备案表二》及劳动合同书;
2.因合同到期终止劳动关系的，需提供到期的劳动合同书 ;
3.因劳动者辞职解除劳动关系的，应提供劳动者辞职报告;
4.其它。
找法网提醒您，事业单位合同工辞职程序是：
1.本人上向单位提交辞职申请；
2.单位在收到辞职申请后，三个月内应办理相关手续(如果按规定不存在不能辞职的情况话)；
3.单位将该人的辞职情况向同级人事部门备案。
《劳动合同法》第三十六条
用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
第三十七条
劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
申请离职后可以进行劳动仲裁，但是需要在仲裁时效内。劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。若是劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条
劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
