犯传染病菌种、毒种扩散罪，后果严重的，判三年以下有期徒刑或者拘役，后果特别严重的，判三年以上七年以下有期徒刑。该罪的主体是从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，主观方面是过失。
法律依据：《中华人民共和国刑法》第三百三十一条
从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役;后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
第三百三十二条 违反国境卫生检疫规定，引起检疫传染病传播或者有传播严重危险的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。
传染毒种扩散罪立案标准是：
1.造成人员重伤或者死亡的；
2.严重影响正常的生产、生活秩序的；
3.导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
4.导致甲类和按甲类管理的传染病传播的。
法律依据：《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(一)》第五十条，从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
(一)导致甲类和按甲类管理的传染病传播的；
(二)导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
(三)造成人员重伤或者死亡的；
(四)严重影响正常的生产、生活秩序的；
(五)其他造成严重后果的情形。
找法网提醒您，传染病菌种毒种扩散罪构成要件如下：
1.客体要件
本罪侵犯的客体是国家关于传染病防治的管理制度，具体是国家的传染病菌种、毒种管理制度。
2.客观要件
本罪在客观方面表现为行为人违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的行为。
3.主体要件
本罪的主体为特殊主体，只限于从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，而且只能是依照国家有关规定享有从事传染病菌种、毒种实验、保藏、携带、运输工作资格的单位中的直接负责的主管人员和其他直接责任人员。不具有从事传染病菌种、毒种实验、保藏、携带、运输的资格，而擅自从事上述事务，因而引起菌种、毒种扩散的，不能以本罪论。单位不能成为本罪主体。
4.主观要件
本罪在主观方面表现为过失。即行为人对其违反国务院卫生行政部门的有关规定造成的后果是出于过失的心理态度。
