理解涉外案件中的特殊管辖规定有：对享有外交特权与豁免的外国人、外国组织或者国际组织提起的民事诉讼，应当依照中华人民共和国有关法律和中华人民共和国缔结或者参加的国际条约的规定办理。人民法院审理涉外民事案件，应当使用中华人民共和国通用的语言、文字。当事人要求提供翻译的，可以提供，费用由当事人承担。其他特殊规定等。
找法网提醒您，根据《民法典》第二百六十一条对享有外交特权与豁免的外国人、外国组织或者国际组织提起的民事诉讼，应当依照中华人民共和国有关法律和中华人民共和国缔结或者参加的国际条约的规定办理。
第二百六十二条人民法院审理涉外民事案件，应当使用中华人民共和国通用的语言、文字。当事人要求提供翻译的，可以提供，费用由当事人承担。
当涉外合同中的管辖法院存在瑕疵时，当事人可以通过以下方式处理：
1.协商解决：当事人可以通过友好协商的方式，共同商定另选管辖法院，并签署书面协议使协议具有法律效力。
2.提交仲裁：当事人可以根据合同的约定，向约定的仲裁机构提起仲裁。仲裁机构可以根据当地法律规定，作出适当的管辖裁决。
3.提起诉讼：当事人可以根据当地的法律规定，在另一个管辖法院提起诉讼。在此情况下，原本的管辖法院有可能被认为没有管辖权。
涉外合同的管辖权是可以约定的。涉外合同可以约定处于境内的被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等地点的人民法院管辖。涉外合同约定管辖不违反级别管辖和专属管辖规定的有效。
