医疗纠纷损害赔偿如下办理：
1.直接向医疗机构协商申请；
2.向当地的卫生行政部门申请处理，调解医疗机构进行赔偿；
3.向法院起诉，裁决医疗机构进行赔偿。
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
医疗纠纷归责原则是过错责任原则、推定过错责任原则等。医疗机构或者其医务人员对患者在诊疗活动中受到的损害有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。且存在违规操作、隐匿病历资料等情形之一的，推定医疗机构有过错。
《民法典》第一千二百一十八条患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
找法网提醒您，医疗纠纷的诉讼时效是三年。当事人因医疗纠纷提起诉讼的，应当递交起诉状。起诉超过诉讼时效的，义务人可以提出不履行义务的抗辩，但是人民法院不得主动适用。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
