确认劳动合同无效的机构是：
劳动争议仲裁委员会或者人民法院确认。
《劳动合同法》 第二十六条
下列劳动合同无效或者部分无效：
（一）以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；
（二）用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；
（三）违反法律、行政法规强制性规定的。
对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。
1.劳动关系归于消灭。
劳动合同的订立违背了当事人一方或双方的真实意思，或者违反了法律、行政法规的强制性规定，这样的劳动合同被认定为全部无效的情况下，双方当事人之间的劳动关系自然归于消灭。
2.劳动者已付出劳动的，用人单位应支付报酬。
劳动合同被确认无效，无论是哪一方的过错，只要劳动者已经付出劳动的，用人单位就应当向劳动者支付劳动报酬，但是劳动者与用人单位恶意串通，共同损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益的除外。劳动报酬的数额，可以参考用人单位相同或相近岗位劳动者的劳动报酬确定;用人单位无相同或相近岗位的，按照本单位职工平均工资确定。如果用人单位与劳动者在合同中约定了工资条款的，除工资条款违反国家法律、法规的强制性规定，或者双方当事人恶意串通侵害社会公共利益的情况外，只要当事人约定的工资条款是双方真实意思的体现，劳动报酬的数额可以按照双方约定的条款确定。
3.有过错的一方承担赔偿责任。
劳动合同被确认无效，给对方造成损害的，有过错一方应当承担赔偿责任。
4.用人单位为劳动者提供合同被确认无效以前的各项福利待遇。
如果用人单位对劳动合同无效有过错的，用人单位应当向劳动者依法提供劳动合同被确认无效以前的各项福利待遇，包括各项社会保险和住房公积金等，但是劳动合同因主体不适格而无效的除外。如果劳动合同无效是因为劳动者的原因，用人单位则无须向劳动者提供各项福利待遇。
找法网提醒您，申请劳动合同无效是有时效限制的，劳动仲裁的仲裁时效是一年。劳动合同不同于一般经济合同，具有社会性，即使案由是确认劳动合同无效，还是应该考虑仲裁时效是一年。但不管是劳动者还是用人单位，时效的起算应该从指导或应当知道劳动合同无效时起算。
