公司员工社保补缴按照如下方式补缴：
1.用人单位通过社会保险经办机构或社会保险网上服务平台下载用人单位及职工相关参保信息导入本地“社会保险信息系统企业管理子系统”。
2.用人单位通过“社会保险信息系统企业管理子系统”录入社保补缴明细。
3.用人单位补缴录入完成，导出社保补缴报盘文件并打印出《社会保险补缴明细表》、《基本医疗保险补缴情况表》各一式三份，加盖单位公章。
4.单位申请报告(写明职工姓名、身份证号码、补缴原因、需要补缴的时间段等事项)。
5.经职工本人签字确认的需补缴时间段的缴费基数明细。
6.职工在参保期间，因工作单位变动等原因中断社会保险关系需补缴近三个月社会保险费时，用人单位可直接通过“社会保险信息系统企业管理子系统”报盘，并打印相关社保补缴明细表进行申报。
找法网提醒您，单位不缴纳社保可以辞职，用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费的行为是违法的，国家强制性要求用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费；则劳动者可以随时解除劳动合同，无须承担任何责任。
《劳动合同法》第三十八条
用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；
（二）未及时足额支付劳动报酬的；
（三）未依法为劳动者缴纳社会保险费的；
（四）用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；
（五）因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。
单位承担的社保比例如下：
养老保险：用人单位缴费比例是16%；个人缴费比例是8%；
失业保险：用人单位缴费比例是0.6%、个人缴费比例是0.4%；
医疗保险：用人单位缴费比例是6.5%；个人缴费比例是2%；
生育保险：用人单位缴费比例是0.8%，个人不缴纳。
