公司债务催收的处理方式有：
1.首先进行协商处理；
2.仲裁或诉讼，对于即将超过诉讼时效的单位，马上准备采取法律措施进行催讨；
3.对于由于公司内人员造成的欠款，先从内部制度上和严格管理上消除此类欠款的继续发生，同时采用适当的公司内部制度和法律手段敦促该项欠款的积极回收；
4.在执行过程中对被执行人的到期债权予以强制执行。
企业债务纠纷诉讼时效是三年。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
企业债务申请执行的期间为二年，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算。
申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。前款规定的期间，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从规定的每次履行期间的最后一日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。
