医疗纠纷仲裁程序如下：首先是当事人申请仲裁，仲裁委员会收到仲裁申请书之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知当事人。仲裁庭处理医疗纠纷应当先行调解，在自愿合法的原则下促使医患双方达成和解协议。若调解不成功则不应久调不决，仲裁庭应当及时作出裁决。
找法网提醒您，解决医疗纠纷的基本原则：
1.坚持不以医疗事故鉴定为前置的原则，医疗纠纷不同于医疗事故，不以鉴定为前提；
2.医患双方地位平等原则，我国民法中规定了法律面前人人平等原则；
3.坚持过错原则，双方当事人依照其各自的过错承担责任。
《医疗事故处理条例》第三条
处理医疗事故，应当遵循公开、公平、公正、及时、便民的原则，坚持实事求是的科学态度，做到事实清楚、定性准确、责任明确、处理恰当。
1.医疗纠纷的双方可以自愿协商；
2.医疗纠纷的一方或双方可以申请人民调解；
3.申请行政调解；
4.向人民法院提起诉讼；
5.法律、法规规定的其他途径。
医患双方选择协商解决医疗纠纷的，应当在专门场所协商，不得影响正常医疗秩序。医患双方人数较多的，应当推举代表进行协商，每方代表人数不超过5人。
协商解决医疗纠纷应当坚持自愿、合法、平等的原则，尊重当事人的权利，尊重客观事实。医患双方应当文明、理性表达意见和要求，不得有违法行为。协商确定赔付金额应当以事实为依据，防止畸高或者畸低。对分歧较大或者索赔数额较高的医疗纠纷，鼓励医患双方通过人民调解的途径解决。
