非法搜查案件怎么处理，需要根据情节进行确定。分别是：
1.犯罪嫌疑人会被人民法院判处三年以下有期徒刑或者拘役；
2.司法工作人员滥用职权，犯非法搜查罪的，从重处罚。
法律依据：《中华人民共和国刑法》第十三条
【犯罪概念】一切危害国家主权、领土完整和安全，分裂国家、颠覆人民民主专政的政权和推翻社会主义制度，破坏社会秩序和经济秩序，侵犯国有财产或者劳动群众集体所有的财产，侵犯公民私人所有的财产，侵犯公民的人身权利、民主权利和其他权利，以及其他危害社会的行为，依照法律应当受刑罚处罚的，都是犯罪，但是情节显著轻微危害不大的，不认为是犯罪。
找法网提醒您，非法搜查罪的认定：
1.主体是一般主体。凡达到刑事责任年龄且具备刑事责任能力的自然人均能构成本罪；
2.在主观方面表现为故意；
3.侵犯的客体是他人的隐私权；
4.在客观方面表现为实施了对他人身体、住宅非法搜查的行为。非法搜查罪是指违反法律规定，对他人身体、住宅进行搜查的行为。
非法搜查罪立案标准：
1.非法搜查他人身体、住宅，手段恶劣的；
2.非法搜查引起被搜查人精神失常、自杀或者造成财物严重损坏的；
3.三次以上或者对3人（户）以上进行非法搜查等。非法搜查罪立案标准
《刑法》第二百四十五条
非法搜查他人身体、住宅，或者非法侵入他人住宅的，处三年以下有期徒刑或者拘役。
司法工作人员滥用职权，犯前款罪的，从重处罚。
第十四条
明知自己的行为会发生危害社会的结果，并且希望或者放任这种结果发生，因而构成犯罪的，是故意犯罪。
故意犯罪，应当负刑事责任。
