公司申请破产债务偿还是应当以公司的全部财产承担。具体如下：
1.破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，先清偿破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用；
2.破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配，破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
《中华人民共和国企业破产法》第八条
向人民法院提出破产申请，应当提交破产申请书和有关证据。
破产申请书应当载明下列事项：
（一）申请人、被申请人的基本情况；
（二）申请目的；
（三）申请的事实和理由；
（四）人民法院认为应当载明的其他事项。
债务人提出申请的，还应当向人民法院提交财产状况说明、债务清册、债权清册、有关财务会计报告、职工安置预案以及职工工资的支付和社会保险费用的缴纳情况。
公司的赔偿金要扣税，但仅限于超过当地上年职工平均工资3倍数额之外的部分。找法网提醒您，法律规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。
破产债权主要包括：
1.破产宣告前成立的无财产担保的债权;
2.放弃优先受偿权的有财产担保的债权;
3.破产宣告时尚未到期的债权;
4.因破产宣告而解除经济合同造成对方当事人经济上损害的部分;
5.虽有财产担保但其债权数额超过担保物价款且未清偿部分;
6.票据发票人或背书人被宣告破产而承兑人已付款或承兑的;
7.被保证人被宣告破产前，保证人代替被保证人清偿债务的部分都列作破产债权。
