农村自留地被别人占用的处理如下：
1.与直接侵权人协商处理，要求停止侵权行为；
2.找当地村委会，派出所进行调解处理；
3.收集侵权的证据，然后去法院起诉，要求停止侵权，排除妨碍；
法律依据：《土地管理法》
第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
侵占土地适用诉讼时效。侵占土地的诉讼时效是3年，土地使用权产生侵权纠纷，当事人向人民法院主张权利时，受到诉讼时间地限制。 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
法律依据：根据《民法典》第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。 但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。
找法网提醒您：占用土地赔偿标准如下：
1.征用耕地、蔬菜地，根据国家规定的价格政策，按该土地征用前三年平均年产值（下同）的六倍计算；
2.征用鱼塘、藕塘、养殖场、果园、竹园、林地等土地，按该土地年产值的五倍计算；
3.征用柴山、滩地、水塘、苇塘和其他有收益的非耕地，按该土地年产值的三倍计算；
4.征用宅基地按邻近耕地的补偿标准计算；房屋由建设单位另行征地移迁重建的，原宅基地不再给予补偿；
5.征用无收益的非耕地，一般不予补偿。
6.征收耕地补偿标准旱田平均每亩补偿5.3万元。水田平均每亩补偿9万元。菜田平均每亩补偿15万元。
7.征收基本农田补偿标准旱田平均每亩补偿5.8万元。水田平均每亩补偿9.9万元。菜田平均每亩补偿15.6万元。
