分公司独立核算如下报税：
1.首先去银行开立一个扣税账户，然后去税所备案，以后就只需要在网上申报他会自动在银行扣款，所以你要保证那个扣税账号有足够的钱来扣款．
2.增值税是按月申报的（国税局），不管是否有无收入，都必须申报，申报期一般是每个月的15号前，如有法定假日会顺延．
3.企业所得税的话是实行季度预缴的，（因为你询问的是增值税，所以我想你的企业所得税应该也是在国税交）一般也是季度后的月份15号前（4月15、7月15等）。
在分公司领取营业执照30日内，到税务机关办理税务登记证。需随带以下资料:
1.营业执照或其他核准执业证件原件及影印件；
2.法定代表人（负责人）和办税人员居民身份证（护照或其他证明身份合法证件）影印件；
3.组织机构程式码证原件及影印件；
4.生产经营场所证明覆印件（房屋产权证和租赁协议书）；
5.总机构营业执照和税务登记证（国税）影印件；
6.《税务登记表》一式二份。
找法网提醒您，分支机构独立核算和非独立核算主要有以下几点区别：
1.定义不同。
独立核算的意思是，某一会计主体对其资金状况和经营成果进行全面、系统的会计核算。根据《会计法》第二条的规定，国家机关、社会团体、公司、企业、事业单位和其他组织必须依照本法办理会计事务。也就是说，这些单位均属于独立核算的会计主体。
非独立核算又称报帐制，通常是指独立核算的会计主体下设的内部会计主体，它们通常没有银行账户，不单独设置账套，不设置会计部门和人员。由上级单位拨给运营资金，从事业务活动的支出由上级单位报销，收入上缴给上级单位。
2.权力大小不同。
独立核算的分公司允许自己单独设置账套、会计人员、独立报税，享有较大自主权。
非独立核算的公公司则不能自己报税，没有自主权力。
3.特点不同
独立核算单位的特点是在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户。独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同。独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。
非独立核算单位的特点是一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。
