起诉书中的另案处理是指在办理刑事案件过程中，对于涉嫌共同犯罪案件或者与该案件有牵连关系的部分犯罪嫌疑人，由于法律有特殊规定或者案件存在特殊情况等原因，不能或者不宜与其他同案犯罪嫌疑人同案处理，而从案件中分离出来单独或者与其他案件并案处理的情形。
根据《关于规范刑事案件“另案处理”适用的指导意见》第二条，“另案处理”使用的情况主要有以下几种：
1.犯罪嫌疑人在逃，一直没有归案，而其他嫌疑人的犯罪事实已查清，或者关押时间已到，只好在提请批准逮捕书或起诉意见书中对在逃的嫌疑人使用“另案处理”；
2.因一时证据较难调取或者办案工作量大，而暂时搁置去干其他的工作，但这一搁置就是几个月甚至更长的时间，本案诉讼期间到了，只好对未查清犯罪事实的嫌疑人使用“另案处理”。
找法网提醒您，另案处理一般在五至六个月判决结案。
一般刑事案件大致要经过3个阶段，即侦查阶段、审查起诉阶段和审判阶段。如果不存在延长的情形，一般刑事案件应该在6个月内结案。
另案处理就是不和这件案子一起处理，另外立案进行处理，是不是没事了要根据具体情况以及情节判决。另案处理是一个法律专业名词，属于司法实践中常遇到的一种情况，多存在于共同犯罪案件，更准确、完整表述应是“另行立案追究刑事责任”。被“另案处理”的犯罪嫌疑人不少人都涉嫌“窝案”，只是由于某种原因，而被列入“另案处理”的范畴。这些原因可能是有的犯罪嫌疑人在逃未归案而无法并案处理，或者可能是在某些刑事案件中，部分犯罪嫌疑人由于年龄、刑事责任能力等方面的原因，不负刑事责任，需要“另案处理”。
