医患纠纷的调解程序是：首先是申请调解，卫生行政部门受理后，会询问双方当事人的意见，根据当事人双方自愿原则，并依据相关法律法规的规定计算赔偿数额，随后制作调解书，双方没有其他意见的话，可在调解书上签字，双方当事人应当履行；调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。
医疗纠纷调解书注意事项如下：
1.医疗纠纷的调解组织
依主持者的性质，调解可以分为：行政机关的调解、民间（组织）调解、法院附设的诉讼前调解等。有必要在卫生行政机关调解之外发展民间组织的调解以及法院诉讼前调解，扩大医疗纠纷当事人对调解组织的选择范围，以利于公正合理地解决医疗纠纷。
2.调解与其他纠纷解决方式的衔接
调解的本质属性是契约性，许多国家的法律对此都予以明确确认。找法网提醒您，即便在有些情况下，法律规定在启动某一个争议解决方式之前，必须进行强制性调解，所谓的强制性调解也不应被理解为侵害了调解的契约性质，因为调解协议的达成仍取决于当事人之间的合意。
医疗纠纷的原因有由医疗过错和过失引起的。具体如下：
1.未尽到与当时的医疗水平相应的诊疗义务；
2.违反了有关的诊疗规范的规定，例如未履行对病人或其家属的病情、治疗方案等告知义务；
3.未妥善保管病例资料。
