夫妻分居满两年不可以自动解除婚姻关系。婚姻关系解除的方式有两种，一是协议离婚经民政部门登记，二是到法院诉讼离婚。所以无论分居多长时间婚姻关系都不会自动解除，离婚必须通过相应的法律途径。民法典规定夫妻双方因感情不和分居满两年一方起诉到法院经调解无效应准予离婚，但不是分居满两年婚姻关系就自动解除，更不是离婚前必须先分居两年。法院解除婚姻关系的判断标准是夫妻感情是否破裂，而分居只是认定感情破裂的因素之一。
分居协议书符合条件的情况下会有法律效力，书写时须满足法律规定的中的相关要求，主体合格、内容合法、意思表示真实，在签订时建立在自愿、平等的基础上，这样才会具有法律效力。
分居后一方债务的处理首先要证明债务的属性，属于一方个人债务的归一方承担；属于双方共同债务的归夫妻共同承担。夫妻共同债务，首先应当由共同财产偿还；共同财产不足清偿或者财产归各自所有的，由双方协议清偿；协议不成的，由人民法院判决。找法网提醒，一般来说，下列债务属于夫妻共同债务：
1.夫妻共同从事生产、经营活动所负的债务，或者一方从事生产经营活动，经营收入用于家庭生活或配偶分享所负的债务。
2.夫妻一方或者双方治病以及为负有法定义务的人治病所负的债务。
3.因抚养子女所负的债务。
4.因赡养负有赡养义务的老人所负的债务。
5.为支付夫妻一方或双方的教育、培训费用所负的债务。
6.为支付正当必要的社会交往费用所负的债务。
7.夫妻协议约定为共同债务的债务。
