无牌无证摩托车被扣了要及时的缴纳罚款，接受处理才能把车取回。但也分以下情形：
1.如若提供的驾驶证真实、合法并且在驾驶时无任何违法行为的，给予警告或20-200元的罚款，及时退还机动车；
2.如若提供的驾驶证真实、合法但在时有违法行为的，根据其违法的情况和未随身携带驾驶证一并予以处罚，并及时退还机动车；
3.如驾驶人不能提供真实、合法的机动车驾驶证，视为无证驾驶，可按照无证驾驶的情形处理。
无证驾驶摩托车被抓不会留案底，无证驾驶被拘留的是属于行政处罚，是没案底的，案底指的是犯罪记录。找法网提醒您，因无证驾驶被拘留的，在公安部门肯定是会有违法记录的。
法律依据：根据《行政处罚法》第七条公民、法人或者其他组织因违法受到行政处罚，其违法行为对他人造成损害的，应当依法承担民事责任。 违法行为构成犯罪，应当依法追究刑事责任，不得以行政处罚代替刑事处罚。
摩托车无证驾驶发生交通事故责任，是由公安机关交通管理部门根据当事人的行为对发生道路交通事故所起的作用以及过错的严重程度，来划分当事人的责任。因违反《中华人民共和国道路交通安全法》和其他道路交通管理法规、规章的行为，过失造成人身伤亡或财产损失所应承担的责任。
1.因一方当事人的过错导致道路交通事故的，承担全部责任;
2.因两方或者两方以上当事人的过错发生道路交通事故的，根据其行为对事故发生的作用以及过错的严重程度，分别承担主要责任、同等责任和次要责任;
3.各方均无导致道路交通事故的过错，属于交通意外事故的，各方均无责任。
一方当事人故意造成道路交通事故的，他方无责任。
省级公安机关可以根据有关法律、法规制定具体的道路交通事故责任确定细则或者标准。
