失踪人员失踪两年后可以注销户口。公民失踪超过一定年限的，由失踪人员家属或单位、村委会向人民法院申请失踪人员死亡，人民法院根据实际情况做出判决后，才可以注销户口。找法网提醒您，人民法院接到失踪申请后还要向社会公告3个月寻找失踪人，最后以判决方式宣告失踪。
《中华人民共和国民法典》第四十条宣告失踪的条件公民下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告他为失踪人。战争期间下落不明的，下落不明的时间从战争结束之日起计算。
失踪人口身份证还能用。失踪人口可以重新去户口登记机关申报登记，变更之前的失踪登记；或者由户主为其申报变更登记，恢复户口登记至正常使用状态。
《中华人民共和国民法典》
第四十一条宣告失踪的法律后果失踪人的财产由他的配偶、父母、成年子女或者关系密切的其他亲属、朋友代管。代管有争议的，没有以上规定的人或者以上规定的人无能力代管的，由人民法院指定的人代管。失踪人所欠税款、债务和应付的其他费用，由代管人从失踪人的财产中支付。
失踪人口注销户口需要的材料有：
1.注销法定事由证明材料，例如，死亡证明、服役材料、逮捕证明等；
2.注销人口的合法有效居民户口簿；
3.注销人口的居民身份证；
4.需要的其他材料。
