农民工工资个人所得税标准即根据个人工资减去五千后来计算。应纳税所得额=税前工资收入金额-五险一金(个人缴纳部分)-费用减除额；应纳税额=应纳税所得额×税率-速算扣除数。找法网提醒，个人所得税中有专项扣除项目，比如房贷、租房、子女教育、赡养老人、本人继续教育等抵扣项。农民工需要下载个税APP填报个人信息、服务单位和自己能够抵扣的项目，这样税务系统在计算需要扣缴的个税时会自动扣除相关抵扣项目。在每年月初时候，需要完成个税的综合年度汇算。
农民工个人所得税的年度汇算可选择下列办理方式：
1.自行办理年度汇算。
2.通过取得工资薪金或连续性取得劳务报酬所得的扣缴义务人代为办理。
3.委托涉税专业服务机构或其他单位及个人（以下称“受托人”）办理，受托人需与纳税人签订授权书。
应当缴纳个人所得税的范围为工资、薪金所得；劳务报酬所得；稿酬所得；特许权使用费所得；经营所得；利息、股息、红利所得；财产租赁所得；产转让所得；偶然所得。个人所得税缴纳税率是个人所得税额与应纳税所得额之间的比例。个人所得税根据不同的征税项目存在对应税率，具体如下：
1.综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。
2.经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。
3.利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
