自然人独资企业营业执照注销流程如下：
1.向税务机关申请办理注销税务登记，领取并填写相应的表格。
2.向注册地工商局申请注销个人独资企业营业执照。
3.需要委托中介机构出具清税报告。如有欠税，缴纳完毕，然后撤销全部银行账户。
4.持清税报告、纳税清算申请表、纳税清算登记表、注销税务登记申请审批表、及注销企业提供的税务登记(正、副本)、代码章、发票卡、IC卡、加密盒、空白发票、上级主管部门或股东会撤销企业决定书、公章到地税注销部门办理注销手续。
自然人独资企业需要交的税费包括以下几项：
1.个人所得税
个人所得税，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。
2.个人独资企业还要根据的经营业务来征税
如果是属于销售生产货物或者度修理修配劳务，要交增值税，税率是4%（工业）或6%（商业）；如果是属于其他的服务业要交地税，税率根据行业知不同从3%到5%，个别行业向网吧是20%。
3.附加税种
如城建税和教育费附加费。
4.印花税。
找法网提醒您，大部分税都不是针对利润征收的，所以和是否赔钱没关系，照样征税。
自然人独资企业有如下特征：
1.个人独资企业是由一个自然人投资的企业。
2.个人独资企业的财产为投资人个人所有。这就确立了个人独资企业的基本财产关系，并决定了其经营成果也归属于投资人个人。
3.个人独资企业的投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任。
4.个人独资企业是一个人投资的经营实体。这就是要求它必须是一个实际存在的、从事生产经营的、能够实际享有权利和承担责任的主体，而不能是一个虚构的市场主体。
