医疗纠纷调解协议签订后，是双方经过充分沟通和平等协商达成的，属于双方真实意思表示，一般是不能反悔或者被法院认定为无效或被法院撤销的。
但是，如果发生了合同法规定的如下情形，则该协议有可能被法院认定为无效或被法院撤销：
1.一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；
2.恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；
3.以合法形式掩盖非法目的；
4.损害社会公共利益；
5.违反法律、行政法规的强制性规定。
下列合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销：
1.因重大误解订立的；
2.在订立合同时显失公平的。
医疗纠纷调解的部门是当地的卫生行政部门。我国法律规定：双方当事人不愿协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，可以向卫生行政部门提出调解申请，经过卫生行政部门的调解达成一致的，应当制作调解协议书。
找法网提醒您，根据《医疗事故处理条例》第四十六条的规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
医疗纠纷调解申请书有效写法是：医疗纠纷调解申请书主要写明当事人基本信息、申请调解的纠纷事实、申请调解的争议要点及理由、申请调解的赔偿金额等。
《医疗事故处理条例》第四十八条规定，已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。
