个人在公司转包的工程合同是无效的，个人是不具有工程施工资质的，并且工程转包行为也是违法的。
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第一条建设工程施工合同具有下列情形之一的，应当根据合同法第五十二条第（五）项的规定，认定无效：
1.承包人未取得建筑施工企业资质或者超越资质等级的;
2.没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义的;
3.建设工程必须进行招标而未招标或者中标无效的。
《中华人民共和国建筑法》第二十八条 禁止承包单位将其承包的全部建筑工程转包给他人，禁止承包单位将其承包的全部建筑工程肢解以后以分包的名义分别转包给他人。
工程转包的法律责任表现为民事责任、行政责任、刑事责任。民事责任体现以下４个方面：
1.转包人与实际施工人之间签订的转包合同无效，已履行的合同内容无法直接返还，应折价补偿。找法网提醒您，建设工程经竣工验收合格，实际施工人可参照合同约定主张工程款，在转包合同履行过程中发生的损失由转包人与实际施工人根据过错责任来承担；
2.因转包产生的拖欠材料款、租赁款、农民工工资等费用，转包人单独或与实际施工人共同承担连带支付的责任；
3.因转包发生的安全事故的责任承担，转包人应当与实际施工人就安全事故承担连带赔偿责任；
4.因转包导致工程质量不合格造成的损失，转包人应当与实际施工人承担连带赔偿责任。
发生建设工程施工合同纠纷可以这么处理：
1.当事人可以通过和解或者调解解决合同纠纷；
2.当事人不愿和解、调解或者和解、调解不成的，可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。涉外合同的当事人可以根据仲裁协议向中国仲裁机构或者其他仲裁机构申请仲裁；
3.当事人没有订立仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉
