商铺房屋契税的计算公式为：房屋总价×税率。一般的商品房买卖的房屋总价，是依照成交时候合同所列价格作为计算房屋契税的基准。至于适用的税率是多少，根据《中华人民共和国契税法》（自2021年9月1日起实施）第三条可知，契税税率为百分之三至百分之五。
商铺房屋除了契税外还要交的费用根据主体性质有所不同：
1.买家税费
（1）房子评估费：550元/本(每提升一本资格证书按每本十元扣除成本费)。
（2）合同印花税：0.05%。
（3）所有权证合同印花税：五元/本。
2.卖家税费
（1）房地产业交易服务费：3元/平米。
（2）合同印花税：房子产价的0.05%。
（3）土地增值税，可出示上手买房税票的，土地增值税=[转让收入-上手发门票(每一年加计5%)-相关税费]×税率。不可以出示上手买房税票的，土地增值税=(转让收入-转让收入×90%)×30%。
（4）增值税及附加税税率，可出示上手买房税票的，为(转让收入-上手发门票)×5.5%。不可以出示上手税票的，为转让收入×5.5%。税费为差值的5.56%。
（5）土地出让金，商业行为用地，按其网格点基准地价的35%计收；商业服务线路价路段路的商业服务沿街土地，另收线路价的10%。
商铺房屋契税什么时候交要看具体情况：
1.如果购买的房屋是新房的，则契税缴纳时间是在交房办证、收房或者交房款的时候缴纳。
2.如果购买的房屋是二手房屋的，则契税缴纳时间是在房屋过户当日。找法网提醒，如果有房产中介协助的，根据房产中介通知办理。
