不需要单独立案。
法律规定
《民事诉讼法》的相关规定
（一）第三十六条 当事人在答辩期间届满后未应诉答辩，人民法院在一审开庭前，发现案件不属于本院管辖的，应当裁定移送有管辖权的人民法院。
（二）第三十五条 两个以上人民法院都有管辖权的诉讼，先立案的人民法院不得将案件移送给另一个有管辖权的人民法院。人民法院在立案前发现其他有管辖权的人民法院已先立案的，不得重复立案；立案后发现其他有管辖权的人民法院已先立案的，裁定将案件移送给先立案的人民法院。
要进行仲裁管辖权异议，首先就必须审议相关争议，是否具有仲裁庭无法管辖的理由，即是否存在仲裁协议或仲裁协议是否有效。如果存在当事人之间不具有仲裁协议或仲裁协议无效的情形，则可以向仲裁庭主张相关争议不应由仲裁庭进行管辖;反之，进行仲裁管辖权异议更多的则在于程序方面的意义。
根据我国《仲裁法》及其司法解释中的相关规定，若存在如下几种情况之一，仲裁庭可能对相关争议不具有仲裁管辖权：
（1）当事人之间不具有仲裁协议;
（2）仲裁协议的达成并非双方的真实意思表示;
（3）协议没有明确的仲裁事项;
（4）争议事项超出了仲裁协议约定的范围;
（5）约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的;
（6）无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议;
（7）一方采取协迫手段，迫使对方订立仲裁协议的;
（8）仲裁机构约定不明的;
（9）同时约定了仲裁和诉讼管辖的。
也就是说，仲裁协议的适用，必须满足三大前提：有仲裁合意、约定明确、符合法定范围。凡是不满足这三大前提的，仲裁协议的效力都可能存在效力瑕疵，即仲裁庭无管辖权，当事人可依法对仲裁管辖权进行异议。
在民事诉讼中，如果法院管辖权存在异议的，具体的审查范围是有法律依据的。根据《民事诉讼法》第三十六条规定，人民法院发现受理的案件不属于本院管辖的，应当移送有管辖权的人民法院，受移送的人民法院应当受理。受移送的人民法院认为受移送的案件依照规定不属于本院管辖的，应当报请上级人民法院指定管辖，不得再自行移送。《民事诉讼法》第三十七条规定，有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决；协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。第三十八条规定，上级人民法院有权审理下级人民法院管辖的第一审民事案件；确有必要将本院管辖的第一审民事案件交下级人民法院审理的，应当报请其上级人民法院批准。下级人民法院对它所管辖的第一审民事案件，认为需要由上级人民法院审理的，可以报请上级人民法院审理。
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