（一）两者的定义不同
车辆购置税主要是针对在我国境内行驶的汽车为课税对象，是在特定的环节进行征收的一种税费，是国家规定必须缴纳的税费之一，由国家税务局征收。
汽车的车船税是指在我国境内应依法到公安、交通、军事等部门进行相关登记的车辆和船舶，根据不同的种类，按照规定的计税价格等进行征收的一种税费，是一种地税，由当地有关部门征收。
（二）征税时间不同
车辆购置税是在购车时一次性缴纳，以后在车辆使用过程中无需在缴纳购置税，如果车辆在购置时已经缴纳过购置税则无需再缴费。
车船税是每年都需要征收的，从2007年7月1日开始需要在投保交强险时缴纳车船税。
（三）缴费标准不同
车辆购置税实行的从价定率来计算应缴纳税额。计算公式为:应纳税额=计税价格×税率。但是计税价格并不是完全按照发票的面额来计算，为了防止商家推销故意开低车价以减少购置税，国家税务总局参照应税车辆市场平均交易价格，规定了不同类型应税车辆的最低计税价格。
车船税是按照固定税额的。计算公式为：应纳税额 = 年应纳税额 ÷ 12 × 应纳税月份数。2012年新的车船税将按7个档次征收，具体车主可以查询相关税率表。
车辆购置税缴纳的时间是从购车之日起的60天内，缴纳方法是携带车主身份证明、车辆价格证明、车辆合格证明到当地的主管国税机关申报纳税。现在，有很多城市都已经推出了车辆购置税网上申报缴纳系统，车主们购车后可以直接在网上申报预约，按照预约的时间和地点去税务机关缴纳，不用排队等候。车辆购置税缴纳完毕后，税务机关会给纳税人一本《车辆购置税完税证明》，车主们要妥善保管。很多汽车4s店也提供了购置税的代缴服务，让车主拿到车之后就可以立即上路，无需担心任何的车辆手续问题。
（一）一般应当自购买之日起60日内申报纳税；进口车一般应当自进口之日起60日内申报税；
（二）纳税人到指定办税服务大厅车辆购置税申报窗口请购或到国税局网站下载、打印《车辆置税纳税申报表》，然后填写。
（三）然后办理纳税申报，纳税人到办税服务厅纳税窗口进行纳税申报，其中须持相关资料包括：车主身份证明原件及复印件，车辆价格证明原件及复印件，车辆合格证明及复印件，进口旧车、因不可抗力因素导致受损的车辆、库存超过3年的车辆、行驶8万公里以上的试验车辆、国家税务总局规定的其他车辆，凡纳税人能出具有效证明的，计税依据为其提供的统一发票或有效凭证注明的价格。
（四）最后进行缴纳税款。
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