(一)行政合同可以使当事人双方的权利、义务关系明晰化，既有利于保证行政目标的实现，又可避免官僚主义。
(二)行政合同可以扩大行政参与，更好地发挥行政相对人的积极性和创造性。
(三)行政合同的订立；使合同双方的争议更易于解决。
(四)行政主体还可通过行政合同，在法律没有规定或者没有具体规定的领域与行政相对人，通过合意来形成其所预期的行政法上的权利义务关系，从而达到弥补立法的不足，并在一定条件下替代立法规制的效果。
(五)行政合同的出现引起了观念上的巨大变革，在理论层面，对现代行政法的概念、基本原则以及制度创新、对市场经济下行政管理方式和管理体制的变革都有积极意义。
认为行政合同违反法律规定的，可以向人民法院申请撤销行政协议或者宣告行政协议无效。
根据《中华人民共和国民法典》第一百四十七条，基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
第一百五十条，一方或者第三人以胁迫手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
（一）行政相对人提起行政诉讼
对行政合同履行过程中的纠纷提起诉讼应该提起的是行政诉讼还是民事诉讼？行政合同虽然叫合同但是按照我国的法律规定行政相对人应该提起行政诉讼，法院在审理订立行政合同这一具体行政行为时附带审查行政合同，这体现了国家对行政权的尊重。因此如果当事人提起了民事诉讼，法院应该告知其变更诉讼请求，提起民事诉讼。值得注意的的是行政合同能否提起行政复议，法律明确规定可以提起行政复议的协议仅限政府特许经营协议、土地、房屋等征收征用补偿协议和其他行政协议，其他合同是否能提起行政复议，只能以具体情况而定。
（二）行政合同案件管辖
搞清楚行政合同纠纷应该提出的是行政诉讼之后，就可以确定应该到哪里提出行政诉讼，依照我国行政诉讼法的规定，一般情况下是到作出行政行为即订立行政合同的行政机关所在地提起诉讼，对不动产纠纷则应到不动产所在地提起诉讼；除非是对国务院部门或者县级以上的政府、海关到中院提起诉讼，其他一律到基层人民法院提起诉讼。
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