专利权人是发明人，现在专利权要转让给自己所在的公司，是向国家知识产权局申请的。但是实际中并不是所有的国务院专利行政部门都叫国家知识产权局，所以，请自行根据当地的实际情况进行最终确定。
《中华人民共和国专利法》第十条专利申请权和专利权可以转让。
中国单位或者个人向外国人、外国企业或者外国其他组织转让专利申请权或者专利权的，应当依照有关法律、行政法规的规定办理手续。
转让专利申请权或者专利权的，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效。
专利转让可分为专利申请权转让和专利所有权转让。专利申请权转让是指专利申请权人将其拥有的专利申请权转让给他人的一种法律行为。专利所有权转让是指专利权人将其拥有的专利权转让给他人的一种法律行为。
在专利转让中，专利申请权人或专利权人为转让方，获得专利申请权或专利权的为受让方，转让方与受让方之间应当签订书面合同，并在国务院专利行政部门进行登记。通过转让合同取得专利申请权或专利权的合同当事人，即成为新的专利申请权人或专利权人，可以行使自身的专利申请权或专利权。
书面形式和登记及公告是专利申请权转让合同和专利权转让合同生效的法定条件，未签订书面形式或未经国务院专利行政部门登记和公告的转让合同不受法律保护。
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