只要该暗股协议的内容合法，并且是双方当事人的真实意思表示的，则该协议受法律保护。法律规定，行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。但是工商登记的股份所有情况对有限责任公司股份的归属具有决定性的影响，而暗股协议中的内容是无法进行工商登记的，将来发生纠纷就无法保护自己的权益了。有限责任公司的实际出资人与名义出资人订立合同，约定由实际出资人出资并享有投资权益，以名义出资人为名义股东，实际出资人与名义股东对该合同效力发生争议的，如无合同法第五十二条规定的情形，人民法院应当认定该合同有效。
1、主体不同：
股票转让的主体是自己的东西股权。买卖主体分为两类，一是一般主体，即凡具有民事行为能力的民事主体均可以作为买卖主体。另一种是特殊主体，即除了具备一般主体的条件外，还须具备法律规定的特别条件才能成为某些买卖关系的主体。
2、实质不同：
股票转让的实质是股权由一方转让至另一方；交易的实质是有价物品及服务进行互通有无的行为；买卖实质上不过是使债权发生效力，出卖人就特定物同时或顺次与数买受人处理买卖契约。《公司法》第一百三十九条，记名股票，由股东以背书方式或者法律、行政法规规定的其他方式转让；转让后由公司将受让人的姓名或者名称及住所记载于股东名册。 股东大会召开前二十日内或者公司决定分配股利的基准日前五日内，不得进行前款规定的股东名册的变更登记。但是，法律对上市公司股东名册变更登记另有规定的，从其规定。
暗股也受法律保护。实际出资人与名义股东应当订立一份书面协议写明谁是出资人，谁是名义股东，股东的权利由谁享有等问题。法律依据：《中华人民共和国证券法》第十二条 公司首次公开发行新股，应当符合下列条件：
1、具备健全且运行良好的组织机构；
2、具有持续经营能力；
3、最近三年财务会计报告被出具无保留意见审计报告；
4、发行人及其控股股东、实际控制人最近三年不存在贪污、贿赂、侵占财产、挪用财产或者破坏社会主义市场经济秩序的刑事犯罪；
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