目前违章建筑拆除补偿款审计以事后审计为主，审计监督难度大。该项审计大多是发生在拆迁结束以后，房屋基本上拆除完毕，审计时接触的资料多为书面材料，既多又杂，被审计单位提供的数据真实性很难考证，对拆迁房屋是否属违章建筑，是否是规划拆迁红线范围内的更是难以界定，加之涉及群众面广，房屋结构参差不齐，补偿标准不
审计人员需要加强拆迁安置补偿审计业务的学习。目前政府投资审计工作人员局限于工程造价审核和财务决算，缺乏一些土地估价技能，房地产拆迁评估的能力，加之目前审计人员业务素质参差不齐，自身的工作量又大，往往抽不出时间去加强这方面业务的学习。
直接关系到人民群众的切身利益的补偿资金能否足额发放到拆迁户手中，直接关系到群众的切身利益，关系到拆迁区域内的社会稳定。搞好拆迁补偿资金的审计，也是当前建设和谐社会、和谐城市的必然需要。由于城市拆迁大多涉及城市老区、郊区和城乡结合部，群众生活不太宽裕，补偿资金不及时发放到位，就会直接影响到群众的生活和生产恢复。
一般情况下，拆除违建，拆迁者无需补偿，但某些情形下，被拆迁者可获得相关的赔偿。
（一）如果是取得土地使用权的违章建筑，拆迁人在拆迁违建的过程中，因拆迁给土地使用权造成损害的，应适当予以补偿。如果土地使用权是通过出让方式得来，违法建筑人缴足了土地出让金，但未到出让年限的，拆迁人也应补偿被拆迁人造成的土地使用收益的损失。如果土地使用权是通过划拨方式得来的，拆迁人可以不补偿使用该土地的违章建筑人。
（二）违章建筑内的财产可以独立于违章建筑存在，系违章建筑人的合法财产，依法应当受到保护。拆迁人在拆迁的过程中要注意先提醒被拆迁者，搬迁并保护好个人财产，拆迁人对违章建筑内的财产不施加任何保护措施，造成被拆迁人财产受到损失的，被拆迁人可请求相应的赔偿。
（三）违建一般情形虽然不能获得拆迁补偿，但可申请拆迁赔偿，拆迁人在拆迁过程中，由于拆迁程序和手段违法，侵害了被拆迁人和房屋承租人的合法权益时应当依法赔偿损失。被拆迁人的利益受损的，可提出赔偿损失的要求。
《中华人民共和国城市规划法》第40条的规定：“在城市规划区内，未取得建设工程规划许可证或者违反建设工程规划许可证的规定进行建设，严重影响城市规划的，由县级以上地方人民政府城市规划行政主管部门责令停止建设、限期拆除或者没收违法建筑物、构筑物或者其他设施；影响城市规划，尚可采取改正措施的，由县级以上地方人民政府城市规划行政主管部门责令限期改正，并处罚款。”可以得到以下结论：
（一）县级以上地方人民政府的城市规划部门，是处理违章建筑的行政主管部门，拥有对违章建筑进行行政认定的权力；
（二）区分不同情况，对违章建筑的处理方式包括：停止建设、限期拆除、予以没收和补办手续、并处罚款；
（三）在具体适用时，应当根据不同情况，分别采取不同的方式：如果该建设工程处在正在建设过程之中，则应当根据《城市规划法》第40条的规定，由城市规划部门责令其停止建设。如果该建设工程已经完工，且严重影响城市规划，则应当根据《城市规划法》第40条的规定，由城市规划部门作出：限期拆除，或者予以没收的处理。如果该建设工程已经完工，虽然“影响城市规划，尚可采取改正措施的，由县级以上地方人民政府城市规划行政主管部门”作出：补办手续，并处罚款的处理；
（四）在上述法定的处理方式中，我们可以作以下理解：限期拆除，留给了违章建筑业主一定的处理能够转移物料的时间；补办手续，则是对违章建筑的事后确认，使之合法化；
（五）在违章建筑索赔纠纷中，对违章建筑的业主来说，既有不应当受到法律保护的权益，主要表现为由于擅自建设的违法行为而给行为人带来的利益；又有应当受到法律保护的权益，依法享有的申请补办手续、在限期内进行拆除的合法权益。对这两种性质不同的权益，应当区别对待，分别作出适当处理。
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