质量保证金的扣留手续，主要有两种：
1、逐次扣留，即发包人在支付工程进度款时按比例逐次扣留；
2、一次性扣留，即发包人在工程竣工结算时一次性扣留质量保证金。
当事人对质量保修金返还期限有约定的，从其约定；没有约定或约定不明的，缺陷责任期满后，发包人应当将质量保修金返还给承包人，即发包人应当自接受建设工程之日起2年内将质量保修金返还给承包人。
工程质保金的预留是必须的，国务院有关部门对于工程质保金特地下调了相关的比例，也是体现了对于质保金的注重程度。“质保金”是信誉录会员对自己企业信誉的质量保证金。信誉录会员不仅要接受信誉评分、交易评价的监督，同时要接受质量保证金的监督。如果信誉录会员在合作的过程中违反了规则，则需要扣除其相应的质保金作为处罚。
质保金作为工程款的一部分，逾期未支付时通常应适用于工程合同中关于发包人逾期支付工程款的违约责任。在当前工程施工行业处于买方市场的情况下，单独约定高于逾期支付工程款的违约责任，对承包人来讲并不太现实。比较符合实际的作法是，国家相关部门在制订新的工程合同示范文本时，设定逾期返还工程质保金违约责任的规范条款，以逐渐推广适用。
综上可知，工程质保金是可以扣除的，但是在建设工程完成后，如果完成了合同所约定的程度，质保金是要退还的。以上便是找法网小编为您带来关于工程质保金的扣除手续有哪些的相关知识，若大家有什么不了解的亦或是有其他疑问的可以咨询找法网的律师。
