内部审计制度旨在保障单位或企业内部各部门相互牵制、相互监督;财产清查只是定期核对财产物资，通过是否账实相符，来检查内部牵制制度的执行情况。但设立了内部牵制制度，并不能保证其一定得到有效执行;期末账实相符，也不能必然保证内部牵制制度已经有效运行。通过内部审计，对企业内部包括内部牵制制度在内的各项制度和经济活动进行审计，方能确保内部牵制制度的有效运行。
内部审计的内容十分广泛，差异也很大，这主要取决于企业的规模、结构及管理当局的要求。通常，与内部审计的涵义相对应，内部审计的内容主要包括检查四个方面的内容。
1.检查、监督和评价内部会计控制制度。尤其是其中的内部牵制制度的健全性、恰当性及有效性，监督其运行，并提出改进建议。
2.检查、监督和评价财务和经营信息。具体包括用于确认、计量、分类和报告该类信息的措施，以及对某些项目的具体查询，包括详细测试交易、金额和范围;
3.检查、监督和评价经济活动的经济性、效率和效果，包括企业的非财务控制;
4.检查、监督和评价对法律、规定和其他外部要求的遵循情况，以及对管理当局政策、指令和其他内部要求的遵循情况。
而根据国际内部审计师协会，内部审计的内容则具体包括六个项目。
1.查明企业内部数据是否真实可靠;
2.查明企业资产核算是否健全，并保证资产不受任何损失;
3.检查和评价会计、财务和其他控制职能是否健全和充分;
4.查明企业的政策、计划和规章制度是否认真执行;
5.评价企业各部门完成各项任务的质量;
6.提出改进经营管理的建议。
