我们选择仲裁机构时，应该根据具体案件选择仲裁机构。仲裁机构的优劣影响着案件的审理，而审理的结果又直接关系着公司的利益，所以仲裁机构的选择很重要，须谨慎选择。
1、如果系涉外案件，则应首先选择涉外仲裁机构——中国国际经济贸易仲裁委员会仲裁。
贸仲在我国仲裁法生效前，是专门受理涉外案件的仲裁机构。仲裁法生效后，尽管贸仲也开始受理国内争议，但我国绝大多数涉外商事争议也是由贸仲受理。四十年来，贸仲以便捷的程序、优质的服务和公正的裁决在国际、国内仲裁界享有盛名，其裁决已经在世界很多国家得到了强制执行，所以贸仲的裁决在外国执行时更容易得到外国法院的承认和执行。
2、对于省际之间的经济纠纷，最好约定由第三地的地方仲裁机构或中国国际经济贸易仲裁委员会仲裁。
一方面贸仲或第三地仲裁机构与纠纷的双方无任何地缘联系，更易于保障案件审理的独立和公正。另一方面，依据新的仲裁规则，贸仲已可以受理国内经济纠纷，贸仲的独立性也将给当事人公正解决纠纷的信心。
3、对于争议标的大、案情复杂的经济纠纷或者性质独特的争议，应当约定在仲裁员水平高、处理复杂案件能力强的仲裁机构仲裁。
不可否认的是，各地仲裁机构仲裁员队伍的水平是参差不齐的。由于地域的限制，有些地方仲裁机构的仲裁员业务水平还须提高。除中国国际经济贸易仲裁委员会是公认的仲裁员水平最高的仲裁机构外，也有少数地方仲裁机构有着较高水平的仲裁员队伍。
