在实际工作中，在破产申请阶段与和解阶段，一般并不进行破产审计，只有在清算组成立后，由清算组委托会计师事务所实施破产审计，对清算组负责，向清算组出具审计报告。破产审计是在年度会计报表审计的基础上进行的，无论从审计的深度、广度看，还是从审计的难度看，都要比年度会计报表审计面广而复杂，工作量大，可以说是年度会计报表审计的延伸和扩展。
其不同之处是：一是实物审计不同。对材料。低值易耗品、固定资产、产成品和半成品等实物的审查，不是抽查，而是全面清查。二是对应收、应付等往来账款，除了函证外，替代审计不是抽查有关的原始凭证，而是在全面审计的基础上，全面审计和重点审计相结合，确认债权债务的真实性。对数额大的债权债务，如无复询，应当尽可能登门查询取证。三是破产审计要全面重点审查企业破产前六个月内的财务行为及其相关的会计凭证。
根据《破产法》第35条规定：人民法院受理破产案件前六个月至破产宣告之日止的期间内，破产企业的下列行为无效：
(1)隐匿，私分或者无偿转让财产;
(2) 非正常压价出售财产;
(3)对原来没有财产担保的债权提供财产担保;
(4)对未到期的债务提前清偿;
(5)放弃自己的债权。
因此，企业破产之日前六个月内的财务行为和会计业务要进行全面重点审计。审计中如发现违法行为，应及时要求被审企业纠正和调整相关的会计业务，如企业拒绝纠正，应在审计报告中明确披露。
