破产审计重点是对经法院裁定破产前六个月之内仍在持续经营阶段的会计信息进行再确认和监督，对破产裁定日企业会计报表的真实性进行审计和核实。其适用的会计法规应以现行的会计制度为准。
由于企业已进入破产程序，对其不再持续经营的相关科目，除需报批核销的有关资产科目如待处理流动资产净损失和待处理固定资产净损失外，对其他不再持续经营的有关科目如待摊费用、应付工资、应付福利费等科目，要弄清事由，进行分析研究后按规定转作损益，对不宜转作损益的，应列出明细清单留待清算期中再作处置。具体来说，审计重点为：
1、对审计资料进行复核
由于破产前的审计时点的不确定性，因此在接手破产审计时，应将破产前审计中提供的“审计账项调整表”逐项核对企业是否作了调账。对破产前审计的基准日到裁定破产日的会计事项进行审计核实。
2、按照《破产法》规定，对下列事项应提请破产清算组、法院批准或裁定：
1)对各项资产(包括现金、银行长期末达账、有价证券等)的溢缺原因清算组要组织专人核实，确实无法查明的，应提出核销建议。
2)对委托加工材料和委托销售的产品应进行函证或上门核对，经核对有差额的要查明原因作出账务处理。无法查清原因的应作说明，提出核销意见。
3)对待摊费用、递延资产、待处理财产损溢等账户中已形成费用损失部分，作进一步核实后，提出核销的建议。
4)对无形资产应在进一步核实后，确定其中已无实际价值需要核销的数额提出核销建议。
5)对负债，应结合清算组的债权申报工作，要编制“账面应付款与债权单位申报数核对表”，对无法确定原因的差额款提出处理意见。
3、对控股联营投资，应进行对联营企业的财务状况进行调查，确定应收回的投资本金和收益。对法院裁定联营企业一并破产的，应对该联营企业进行彻底审计，并将联营企业资产负债纳入破产企业一并清算。
4、对下述事项应进一步落实：
1)超过3年不能收回的应收款数额及虽未超过3年，但确实无法收回的应收款数额。
2)取得房屋、土地的所有权及使用权证，明确产权归属，进而确定其中破产财产和担保财产的数额。
3)用作抵押财产的有关资料和财产数额。
4)用于企业福利性设施的数额及相关资料。
5、按审计法规要求还应对下列事项逐项核实：
1)对收回的各项资金，应查清来路，验证其是否正常，是否全部入账。
2)对各项支出着重审计其真实性、合法性，尤其应注意有无作弊、虚列支出，甚至贪污私分的问题。
3)复核各项应计费用的计算是否正确，如各项借款利息、折旧费、应付水、电、气费等是否已经足额计提至裁定破产宣告日(可发询证函)。
4)审计是否正确计提了各项税款(可发询证函)。
5)有无擅自归还未到期负债问题。
6)对减少的资产应审查减少的合理性、合法性，尤应注意是否饿故意压价出售，无偿转让、隐匿、私分等问题。
7)审查有关账项的调整，核销情况，检查其理由是否充分，有无擅自调减资产、调增亏损的问题。
8)审查各项已实际发生的收入和支出，是否已全部入账。重点督促企业职工将手持的支出凭证(如医药费单据、差旅费单据等)及代企业收回的现金、有价证券、个人持有的备用金等全部交财务部门入账。
9)冲销坏账准备，对企业坏账准备尚未销账的，以及按《民法通则》超过三年的应收款项及财政部门对超过三年以上难以收回的应收款项，可按账面价值的 70%提取坏账准备，1年以上3年以内难以收回的应收款项，可按账面价值的40%计提坏账准备的规定，在审计中对所计提的坏账准备予以冲销。
