公司从本质上来说，是一种资合组织，通俗点说，公司是资本的联合，各种资本联合在一起形成一个经济组织，按照资本比重决定话语权，大股东可以一个人决定公司的前途与命运。合作社其实是人合组织，也就是人的联合。也许有些人还会想起来另外一种任何组织——合伙企业。所以它们之间有什么区别?
一、组织性质
公司是资合组织，资本说了算，谁出资多谁是大股东谁就是老大。因为出资多对公司的作用就大，冒得风险也就大，当然在公司中的地位就高。而合伙企业与合作社都是人合组织，虽然都是经济组织，但是这两者都强调成员之间的平等关系，也就是民主管理，人之间的合作前提必须是自愿与平等，每人都有一票表决权，而不是谁出资多谁做主。一个资本说了算，一个人多说了算，这就是公司与合作社、合伙企业的最大区别。
二、承担的责任
公司承担的是有限责任，公司股东仅仅以其出资额为限承担有限责任，赔光了就算完事，再多的债务也不能牵涉到其个人及其家庭资产。合伙企业成员则要对企业的债务承担无限连带责任，一旦企业的资产不足以清偿债务，所有的成员都要以自己的个人资产对未偿清债务负责，直到所有债务都得到偿还。因此合伙企业对债务承担的是无限连带责任。而合作社与公司又比较类似，成员仅以其出资额为限承担有限责任。
三、利润分配
公司的利润最后要按照出资额比例，给股东分红，出资越多，分红越高，当然有亏损的话，承担的损失也越高。而合作社60%的利润要按照交易额返还给社员，只有40%的利润按照出资额返还，这体现了合作社充分重视生产者的利益。合伙企业的利润是是按照合伙协议的约定分配，但是没有约定或者约定不清楚的话，可以协商解决，协商不成，则按出资额比例分配，出资额不清的话，平均分配。
因此，合作社是介于公司与合伙企业之间的一种特殊的经济组织，它与公司相同之处是仅仅以出资额为限承担有限责任，与合伙企业相同之处是成员之间实行民主决策，一人一票。这就体现了合作社的特殊之处，既实行民主管理又承担有限责任，在实践中面临的问题当然也会比较多。
