在农村集体建设用地流转过程中，工业化、城市化是农村集体土地流转的外在推力，土地利用收益分配机制不合理是集体土地使用权流转的内在动力。随着社会经济的快速发展，农村集体土地使用权的流转一直处于比较尴尬的地位。解决农村集体土地使用问题迫在眉睫。
(一)农村集体耕地被地方政府滥征用
农村土地的流转在试点过程中出现了不少不规范问题。由于农村集体用地制度不完善，具体征用程序操作不规范，导致农民土地权益受损、违规用地的现象时有发生。流转过程的价格随意性大，征地价格偏低，如何流转基本上由地方政府所垄断，个别政府官员为征地大户跑路子、拿回扣，对农民补偿不到位等损害农民利益的现象时有发生。
(二)我国农村宅基地管理混乱
农村宅基地分布松散，布局不合理，严重浪费了土地资源。很多城市市民几代居住城市，农村的老宅依然存在，几近荒芜。而有的农民在农村竟然有多处宅基地，且面积巨大。随着我国经济的飞速发展，大量农村人涌入城市，从而造成大量闲置民宅及空心村。
另外，在许多经济发达的地区农村宅基地私下流转现象很普遍，相关宅基地流转的法律法规的空白和滞后，由此产生的宅基地产权纠纷也日渐增多，扰乱了土地市场的正常秩序。
