法院经审理查明，1988年，原告作为邳州市炮车镇敦集村村民，在其位于本村的宅基地上建造房屋五间及院墙。1991年8月4日，原告与所在村组签订农村建设用地（宅基地、空闲地）有偿使用合同书。1995年，原告全家迁往山东省临沂市兰山区，后第三人搬入原告房屋居住至今。2003年6月10日，被告某市人民政府为第三人王某颁发集体土地使用证。2006年8月9日，邳州市炮车镇村镇建设办公室为第三人颁发了村镇房屋所有权证。2009年7月26日，邳州市建设局以颁证程序违法，以及原告与第三人存在房屋产权纠纷为由，作出《关于注销第01111号村镇房屋所有权证的通知》。另查明，因原告与第三人存在房屋产权纠纷，本院已经受理了原告对第三人提起的财产权属纠纷案件。
法院审理后认为，根据《中华人民共和国土地管理法》，土地登记实行属地登记原则，县级以上人民政府具有核发土地权利证书的法定职责。原国家土地管理局发布的《土地登记规则》第六条规定：“土地登记依照下列程序进行：（一）土地登记申请；（二）地籍调查；（三）权属审核；（四）注册登记；（五）颁发或更换土地证书。”第十条明确规定：“土地登记申请者申请土地使用权的，必须向土地管理部门提交以下资料：（一）土地登记申请书；（二）单位、法定代表人证明，个人身份证明或者户籍证明；（三）土地权属来源证明；（四）地上附着物权属证明。”本案被告虽依照登记规则履行了主要登记程序，但土地登记申请的程序操作过于简单，且“地上物类别及权属”的登记不实，个人土地使用权说明书关于“土地权属来源”的记载不实，土地登记申请书中多项内容未予填写。鉴于本案诉争用地上的房屋权属不明，第三人原持村镇房屋所有权证书已被注销的客观事实，被告为第三人所颁发的集体土地使用证依法应予撤销。据此作出如上判决。
