股份转让与内部协议的问题怎么解决？
1、目前我是否还具有股东的身份？并且依照《公司法》的规定，享有和行使股东的权利？如何享有？
是，按公司法享有权利。
2、在目前情况下我是否有权不认可我与法定代表人签署的股份转让协议？
从公司财务拿钱，属于无效协议，对双方都不发生效力，还可能涉及抽逃注册资金或侵占问题。
3、我是否有权依据《新公司法》的规定，可以要求清算公司或清盘公司？
要根据具体情况分析，无法简单答复。
4、“总经理任命协议”是否随着股份的转让也作废了？如果不是的话，我能要回什么样的权利，需要什么手续或方式要回“职务任命”？
总经理与股东身份无直接联系。
5、一旦我重新作为总经理，如果受到股东的工作刁难或阻挠，我有什么相应权利？
公司法有明确规定。
6、由于股东的阻挠等原因导致我未完成协议要求的指标，根据协议规定，我6月份是否会失去总经理权利？或者我有何权利？
看聘用合同的具体约定。
7、”总经理任命协议”与“股份转让协议”是否有冲突？谁有效，谁无效？
见问题2的答复。
