遇到公司股东撤资按照下列方式处理：
1、通过转让股份给第三人的方式实现撤资，对外转让需要经过其他股东过半数同意，股东还有优先购买权；
2、公司与股东可以先行协商，协商一致达成股权收购协议的，即可通过股权收购的方式实现撤资；
3、协商不成的，股东可以自股东会会议决议通过之日起90日内向法院提起诉讼。法律依据：遇到公司股东撤资按照下列方式处理：
1、通过转让股份给第三人的方式实现撤资，对外转让需要经过其他股东过半数同意，股东还有优先购买权；
2、公司与股东可以先行协商，协商一致达成股权收购协议的，即可通过股权收购的方式实现撤资；
3、协商不成的，股东可以自股东会会议决议通过之日起90日内向法院提起诉讼。
法律依据：
《中华人民
共和国公司法》第七十一条
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。
其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
