专利合同多种多样，并非所有的专利合同都是有名合同。但在总体上，有关合同纠纷的解决途径却并无大异。合同是当事人经协商订立的，因此协商解决合同纠纷应当是最为简便的方法。如果经协商无法解决，有关当事人在法律程序方面可以有两种选择，
一是请求合同各方当事认可的仲裁机构仲裁，
二是向法院起诉。
需要指出的是这两种程序是相互排斥的，只能选择其一。若选择了仲裁程序，即意味着排除了司法管辖，仲裁机构的裁定具有终局效力，同样具有法律效力。但若要选择仲裁程序，当事人之间必须达成仲裁协议，即当事人各方同意将其合同纠纷交予某仲裁委员会仲裁。仲裁机构的管辖权来自于当事人各方的约定。仲裁协议可以在合同订立时一并达成，如直接写入主合同;也可以在纠纷发生时再行约定。一旦合同当事人双方已就合同纠纷解决达成了仲裁协议，则法院不再就该合同所生之纠纷享有管辖权。如果当事人各方没有达成仲裁协议，那么纠纷的解决就只能向法院起诉了。
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