（一）行政法上的非法行医认定
《中华人民共和国执业医师法》第14条医师经注册后，可以在医疗、预防、保健机构中按照注册的执业地点、执业类别、执业范围执业，从事相应的医疗、预防、保健业务。未经医师注册取得执业证书，不得从事医师执业活动。
第39条未经批准擅自开办医疗机构行医或者非医师行医的，由县级以上人民政府卫生行政部门予以取缔，没收其违法所得厦其药品、器械，并处十万元以下的罚款；对医师吊销其执业证书；对患者造成损害的，依法承担赔偿责任；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
《执业医师法》第39条规定，未经批准擅自开办医疗机构行为或者非联师行医的，属于医疗行政管理上的非法行为。包括：未经批准擅自开办医疗机构行为；非医师行医的行为。
对于非医师行医，主要是对医师资格的认定。根据《执业医师法》第2条第2款规定，本法所称医师.包括执此医师和执业助理医师。对于执业医师的认定，在该法第14条规定，医师经注册后，可以在医疗、预防、保健机构中按照注册的执业地点、执业类别、执业范围执业，从事相应的医疗、预防、保健业务；未经医师注册取得执业证书，不得从事医师执业活动。因此，可以认为，对医师的认定，不仅仅要看其是否取得医师资格，还要看其是否经过注册取得执业证书。拥有医师资格证书和医师执此证书双证的人员，才可以认定为合格的医师。否则便属于非医师行医。
（二）刑法上的非法行医认定
《刑法》第336条未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，处3年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；严重损害就诊人身体健康的，处3年以上10车以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处10年以上有期徒刑，并处罚金。
未取得医生执业资格的人擅自为他人进行节育复通手术、假节育手术、终止妊娠手术或者摘取宫内节育器。情节严重的，处3年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；严重损害就诊人身体健康的，处3年以上10年以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处10年以上有期徒刑，并处罚金。
我国的非法行医包括非法行医罪和非法行医节育罪两个罪名，都应当认定为非法行医的范畴。在刑法范畴内认定非法行医，主要强调个人行为，即未取得医生执业资格的人为非医师，没有涉及医疗机构。虽然在刑法的表述中仅指未取得医生执业资格项，但是，根据我国《执业医师法》的规定，医师获得执业资格以注册为前提，而医师要通过注册必须具备医师资格，即只有获得医师资格证书的人才能通过注册取得医师执业证书。因此，在刑法上对于非医师的认定也是强调双证齐全。
（三）民法上的非法行医认定
无论是行政法上的概念还是刑法的概念，在认定非医师行医的问题上，显然二者是一致的，仅行政法上认定非法行医时增加了非医疗机构行医的问题。这是行政法和刑法调整的范围不同所决定的。因此，患者所接受的医疗行为，无论是在行政机关管理的范畴，还是当事人遭受非法行医罪的指控，患者都可以通过诉讼起诉非法的医疗机构或者医师，按照一般民事侵权要求赔偿损失。
