中国农业生态环境保护协会主要开展以下业务:
(一)开展学术交流、技术交流。协会每两年至少召开一次学术会议或专题研讨会、座谈会、报告会等;
(二)开展科技研究及考察。组织承担全国性或地域性的调研课题、科技考察和研究课题;
(三)编辑出版科技刊物、专著、科普读物及其他有关科技资料;
(四)普及农业生态环保方面的科学知识,推广先进技术和经验;利用现代传媒手段,开展科技信息传播;
(五)开展继续教育和技术培训工作;
(六)接受政府有关部门的委托,对国家或区域性农业生态环保发展战略、科技政策和重要措施进行决策论证;
(七)开展科技咨询服务,促进科技成果转化;
(八)接受有关部门委托,承担科技项目的评估、科技成果鉴定以及相关项目论证等;
(九)开展民间国际学术交流和科技合作,发展同海外农业生态环保科技团体和科技工作者的友好交往;
(十)开展表彰奖励活动,推荐人才;
(十一)反映广大农业生态环保科技工作者的意见、建议和要求,维护他们的合法权益;
(十二)承担业务主管部门和会员单位委托的其他任务。