工程审计是指审计机构依据国家的法令和财务制度、企业的经营方针、管理标准和规章制度，对工程项目的工作，用科学的方法和程序进行审核检查，判断其是否合法、合理和有效，以及发现错误、纠正弊端、防止舞弊、改善管理，保证工程项目目标顺利实现的活动。 工程审计独立于项目组织之外，审计人员与项目组织无任何直接的行政或经济关系。
工程审计是依据国家《审计法》等相关规定，对工程概、预算在执行中是否超支，有无隐匿资金、截留基建收入和投资包干结余，以及有无以投资包干结余的名义私分基建投资的违纪行为等。审计是以基建项目为标的，以会计师、审计师为主要从业人员。
１、熟悉合同、协议、招投标文件。
先确定合同的计价类型，再仔细研究其中的调价条款，根据结算调价条款进行工程价款审计。根据最高人民法院出台关于审计建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释，分析判断补充条款的有效性。
２、费率的审核。
取费应根据工程造价管理部门颁发的定额、文件及规定，结合工程相关文件（合同、招标投标书等）来确定费率。
３、工程量的审核。
首先要熟悉图纸，再根据工作细致程度的需要、时间的要求和审计人力资源情况，结合工程的大小、图纸的简繁选择审核方法。
４、定额子目套用的审核。
在审核套用预算单价时要注意对直接套用定额单价的审核采用的项目名称和内容与设计图纸的要求是否一致，工程项目是否重复套用。
５、材料价格的审核。
原则上应根据合同约定方法，再结合甲方现场签证确定材料价格。
6、签证的审核。
审核签证的合法性、有效性，一是看手续是否符合程序要求、签字是否齐全有效，二是看其内容是否真实合理，三是复核计算方法是否正确、工程量是否正确属实、单价的采用是否合理。
有政府性投资的建设项目，一律要进行工程审计。即所有行政、事业单位的建设项目都要经过造价审计和财务决算审计。非政府性投资的建设项目，规模较大而且涉及的利害关系人较多的，必须进行工程造价审计，比如房开企业开发的房地产。企业建造自用的建设项目由企业决定是否审计。
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