1、模拟拆迁的模拟过程不透明，不会对所有人进行公布。也就是模拟拆迁过程中，百姓的意愿到底有多少，有关部门并不会对所有人进行公示。因此，一些居民不明就里，就在补偿协议上签了字。剩下的人眼看没有签字的人越来越少，内心比较着急，也草草签字。因此，从根据你的意愿签字，到逼你签字，很大程度上，还是看当地有关部门的意愿。
2、签字的主体不适格。适格是一个法律上的概念，意思是不具备全部或者部分签字的资格。
3、实践中，模拟过程中，就已经开始实际强制拆除了，只要签了模拟协议就等同于实际征收了。所谓的模拟搬迁和征收的有机结合是一句空话。
4、在实践中，征收部门或确定的项目主体，出于利益考量，并不会真正告诉拆迁户所签订的协议是模拟的。往往协议签订了，正式的征收决定间隔很久也未作出，导致征收评估结果与初次评估结果出现重大差异。被征收人无法接受按初次评估结果作为补偿条件，矛盾再次爆发。
如果涉案房屋的拆迁项目程序严重违法，已违反了行政法规、法规和规章的强制性规定。根据《合同法》第五十二条第（五）项规定，违反法律、行政法规的强制性规定所签订的协议依法应当确认无效。
因此，涉案模拟拆迁协议应确认为无效。此外，一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益，恶意串通损害国家、集体或者第三人利益，以合法形式掩盖非法目的，损害社会公共利益的协议也应当被确定无效。
1、与房屋拆迁有关行政许可撤销或确认违法。房屋拆迁依托于政府的行政许可，如果政府行政许可行为被撤销或确认为违法，据此签订的《房屋拆迁补偿协议书》的合法性就存在问题，当事人可依法请求确认《房屋拆迁补偿协议书》无效。
2、房屋估价机构违法或估价不合理。房屋拆迁依托于房屋估价机构的估价行为，如果房屋估价机构不是依法选定的，或者房屋估价机构不依法进行估价，或者房屋估价结果显失公平，当事人可依法请求变更或撤销《房屋拆迁补偿协议书。
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