并购涉及一系列的复杂的法律关系，以这种方式购买商标更要谨慎小心，严格审查，稍有不慎就会留下严重的后遗症。即便是跨国企业在并购中对商标处理都曾出现重大的失误，在达能和哇哈哈系列争议中，当初没有处理好商标问题为后来的争议埋下祸根。在国美收购三联案件中，双方陷入了商标之争，又引发了经营场所之争混战之中。为避免日后的争执，确保获得完成的商标权利，在并购中必须严格审查商标权属，除了基本的审查外，以下方面必须重点审查：
1、权属是否明确
我们一般认为一个商标的权利人只有一个，其实是错误的，商标可以是共有的。如果是共有的商标，必须要经过全体共有人的同意才能出售。共有人有法律上的共有人，还有事实上的共有人，在市场经济中，企业的并购频繁，企业的内部决策权变换也相当的频繁，随着决策权的变换，可能对企业重要的商标的使用权等做不同的调整，而这些调整往往不能在商标证以及商标档案中体现，一旦对外转让，如果发生争议未免殃及池鱼。这个问题很难通过审查解决，则需要要求原商标权利人做出相应的承诺，并承担全部的解决义务。
另外有种情况比较特殊，如果该商标是个人的，尽管没有共有人，但是也必须取得商标权人配偶的同意才行，我国曾经有过这样的案例，妻子以丈夫没有经过其同意出售商标行为无效提起了诉讼，其诉讼主张得到了法院的支持。这种情况并不多见，但是有的企业比较喜欢将公司的商标过户到公司老总或其他人的名下，这时就必须由其配偶出具法律文件，放弃权利，或者同意转让。
2、是否有对外许可
商标许可使用商标法规定是要求到商标局办理备案手续的，但是不备案并不影响许可合同的效力，因此在实践中大量的商标许可使用合同是没有办理备案登记的。因此商标是否有使用许可并不能从公开的途径进行审查，某公司通过法院的拍卖程序获得了一商标，但是该商标被一家公司享有20年的独占许可使用权，这样购买人花了钱，却难以自己使用。这样的例子并不少，独占许可几乎使购买人完全尚失权利，普通的许可也会对购买人使用权限受到重大的影响。
商标使用许可通过公开途径审查到不能确定，当然不能完全信任企业的诚信，因此必须要求被并购的企业做出必要的承诺并在协议中将这些不确定的风险转嫁由被并购的企业承担。
如果并购的主要目的是企业的商标，那么对该商标应当进行全面的审查，尤其是审查是否存在有影响该商标所有权和使用权的因素存在，并采取措施确保解决这些问题，否则整个并购行为将失败。
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