对于保密专利申请审批的流程，需要根据保密的内容不同来确定：
1、内容涉及国防利益的：申请人向国防专利局进行申请——国防专利局给予审查意见，并作出授予国防专利权的决定——颁发国防专利证书，同时在专利公报上进行公告。
2、内容涉及国防利益以外的：申请人提出申请——初步审查和实质审查均由专利局指定的审查员进行——经实质审查符合条件的，作出授予保密专利的决定——发出授予保密专利的通知书和办理登记手续通知书——办理登记手续。
《专利法》第七十一条
违反本法第二十条规定向外国申请专利，泄露国家秘密的，由所在单位或者上级主管机关给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
