员工取得的经济补偿一般是不需要缴纳个人所得税的，但当取得的经济补偿金额超过一定数额时要缴纳个人所得税。
经济补偿金是用人单位解除劳动合同时，给予劳动者的经济补偿。经济补偿金是在劳动合同解除或终止后，用人单位依法一次性支付给劳动者的经济上的补助。我国法律一般称作“经济补偿”，法国《劳动法典》称为“辞退补偿金”，俄罗斯《劳动法典》则称为“解职金”。我国劳动法、1994年劳动部发布的《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》(以下简称《经济补偿办法》)等规定了用人单位在与劳动者解除劳动合同时，应该按照一定标准一次性支付一定金额的经济补偿金。
根据国家税务总局相关文件规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入(包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用)，应当依法缴纳个人所得税。这些规定概括起来应当分别按以下三种情况处理：
1、收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税;
2、超过3倍的部分计算征收个人所得税方法：扣除3倍后的一次性经济补偿收入÷个人在本企业的工作年限数=个人缴税月工资。再以个人缴税月工资为基数按照税法相关规定计算缴纳个人所得税。个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12计算。按照上述方法计算的个人所得税税款，由支付单位在支付时一次性代扣，并于次月7日内缴入国库。
3、个人按国家和地方政府规定比例实际缴纳的住房公积金、医疗保险金、基本养老保险金、失业保险基金在计税时应予以扣除。
